CIOOS Atlantic ERDDAP
Un accès facilité aux données scientifiques

Présenté par NOAA NMFS SWFSC ERD    

ERDDAP > Information

ERDDAP est un serveur de données qui vous offre un moyen simple et cohérent de télécharger des sous-ensembles d'ensembles de données scientifiques dans des formats de fichiers courants et de créer des graphiques et des cartes.

Table des matières

Les problèmes que ERDDAP tente de résoudre

Sans ERDDAP, lorsqu'une personne (ou un programme informatique) recherche sur Internet un type spécifique de données scientifiques (par exemple, des données satellitaires sur la température de la surface de la mer), il y a des problèmes...

Les solutions d' ERDDAP

DAP ? OPeNDAP ? DODS ? ERDDAP ? Quelle est la différence? Ma compréhension (de Bob) est la suivante :

DODS (Distributed Oceanographic Data System) a été créé dans les années 1990, avant l'apparition de http : (!). Le système DODS a créé et utilisé le protocole dods : sur Internet. Lorsque HTTP est arrivé et a connu un tel succès, ils sont passés de dods: à http:.

À un moment donné, ils ont réalisé que le système était utile pour bien plus que de simples données océanographiques. Ils ont donc abandonné ce nom DODS (bien qu'il perdure dans certains codes) et ont formé une petite organisation appelée OPeNDAP  (external link) et écrit la spécification DAP (Data Access Protocol)  (external link), qui standardise le format des demandes de métadonnées et/ou de données, et les réponses avec les métadonnées et/ou les données. OPeNDAP (l'organisation) gère toujours DAP (la spécification) et est l'auteur de Hyrax (le serveur de données qui est souvent appelé à tort OPeNDAP ).

Hyrax, THREDDS, GRADS, ERDDAP et autres sont des serveurs de données (logiciels) qui implémentent DAP . Ils mettent chacun en œuvre un sous-ensemble de DAP mais font d’autres choses de manière très différente.

ERDDAP utilise du code (dans le répertoire "dods") (en fait écrit par Jake Hamby du NASA JPL) pour certaines fonctionnalités de lecture de données à partir de serveurs DAP externes. ERDDAP utilise son propre code pour écrire les réponses DAP .
 

ERDDAP est-il une solution aux problèmes de distribution/accès aux données de chacun ?
Non. ERDDAP essaie de trouver un point idéal qui soit une très bonne solution à la plupart des problèmes de distribution de données auxquels nous avons été confrontés. ERDDAP adopte une approche middleware : il peut obtenir des données provenant de nombreux types différents de serveurs de données distants et peut transmettre ces données aux clients dans de nombreux formats de fichiers différents. Il est conçu pour être une solution agnostique qui cherche à rendre interopérables d'autres serveurs de données (OPeNDAP, SOS, OBIS, WMS, ...). Existe-t-il un serveur de données parfait qui répond parfaitement aux besoins de chacun ? Nous ne le pensons pas. Et même si vous pensez qu’il y en a ou qu’il y en aura, il faudra beaucoup de temps avant que tout le monde n’y adopte, voire jamais. D’ici là, ERDDAP est disponible dès maintenant pour rendre d’autres serveurs de données interopérables et servir les données dès maintenant.

ERDDAP peut gérer la plupart des ensembles de données tels quels, mais pas tous. Ce n'est pas que les ensembles de données restants (par exemple, les données du modèle utilisant une projection de sphère cubique) ne soient pas importants. C'est juste que l'objectif d' ERDDAP de renvoyer les données dans des formats de fichiers courants (dont certains sont assez simples) exclut une structure de données interne plus complexe. Les groupes de chercheurs travaillant avec des structures de données plus complexes disposent souvent déjà de serveurs de données spécialisés et de logiciels clients spécialisés adaptés aux besoins de leur communauté. ERDDAP, en tant que serveur de données à usage général, ne cherche pas à rivaliser avec ces serveurs de données spécialisés. Ils s'adaptent aux besoins de leur communauté et font un excellent travail. Cependant, ces ensembles de données ne sont souvent « compris » que par les logiciels spécialisés de cette communauté.

Une solution de contournement pour les ensembles de données complexes : ERDDAP dispose d'un moyen de gérer des ensembles de données complexes qu'il ne peut pas gérer directement. Tout comme une base de données relationnelle  (external link) peut stocker un ensemble de données complexe en utilisant une seule structure de données simple (une table), ERDDAP peut servir les données d'ensembles de données plus complexes en divisant l'ensemble de données source en quelques ensembles de données ERDDAP, chacun avec des structures de données simples et similaires. Par exemple, certains ensembles de données de modèles environnementaux maillés peuvent être stockés dans ERDDAP en plaçant les variables de surface de la mer ([temps][latitude][longitude]) dans un seul ensemble de données ERDDAP, et en plaçant les variables avec l'altitude ([temps][altitude][ latitude][longitude]) dans un autre ensemble de données ERDDAP . Nous savons que ce n'est pas idéal, mais il est nécessaire de permettre ERDDAP de renvoyer des données dans des formats de fichiers courants (dont certains sont assez simples).

Une autre approche pour traiter des ensembles de données complexes (par exemple, pour les données de modèle utilisant une projection de sphère cubique) consiste également à proposer une version reprojetée de l'ensemble de données ([temps] [altitude] [latitude] [longitude]) avec laquelle ERDDAP peut travailler facilement. Ces structures de données plus simples ne sont pas destinées à remplacer les structures de données d'origine, mais elles peuvent constituer un moyen utile de distribuer les données à un public plus large.
 

Dans quelle mesure le projet ERDDAP est-il durable ?
ERDDAP est très durable.
Certaines personnes sont surprises et déçues d'apprendre ERDDAP est principalement développé par une seule personne (Bob Simons, maintenant Chris John). [À propos, les opinions sur cette page Web sont mes opinions personnelles et ne reflètent pas nécessairement la position du gouvernement ou de l' National Oceanic and Atmospheric Administration .] Ils craignent que si quelque chose m'arrive, ce sera la fin de ERDDAP . Ce n’est tout simplement pas vrai. Le positionnement de ERDDAP en matière de durabilité à long terme est excellent et proche du meilleur possible.

Oui, je suis le développeur principal d' ERDDAP . Je suis un employé fédéral entièrement financé. Mon financement n'est pas de l'argent « doux », donc je ne reçois pas de subventions ni ne dépends de celles-ci. Je passe plus de la moitié de mon temps à développer ERDDAP . Le reste de mon temps est consacré à la gestion d’ensembles de données. Ce travail est utile pour ERDDAP car j'ai besoin de travailler avec des ensembles de données réels afin de savoir en détail ce que ERDDAP doit faire. Mes patrons soutiennent pleinement mon travail sur ERDDAP car il fait ce pour quoi j'ai été embauché : permettre aux scientifiques halieutiques (principalement, mais vraiment à tout le monde) d'obtenir plus facilement des données scientifiques provenant de diverses sources.

Ce qui est miraculeux avec les logiciels, c'est qu'ils ne coûtent rien à dupliquer. Donc, pour faire mon travail, j'écris ERDDAP pour une utilisation chez ERD . Je pense que c'est la meilleure façon possible pour moi de faire mon travail. Cette seule raison justifie les dépenses liées au développement ERDDAP . (Je pense qu'il pourrait être démontré ERDDAP a fait gagner plus de temps aux scientifiques NOAA que j'en ai passé à développer ERDDAP . Temps = Argent.) Mais l'avantage secondaire est que toute autre organisation peut télécharger, installer et utiliser ERDDAP gratuitement pour distribuer son données scientifiques.

Plus de 90 organisations dans au moins 14 pays utilisent ERDDAP . Il existe peut-être un déjeuner gratuit.

ERDDAP est un programme Java . Le code source de chaque version est sur GitHub  (external link), le système le plus couramment utilisé pour les projets logiciels collaboratifs. Crédits Les crédits ERDDAP sont désormais disponibles sur une page séparée . J'espère que d'autres contribueront au code à l'avenir. S'il m'arrive quelque chose, mes patrons embaucheront un remplaçant dans le but précis qu'il continue le développement d' ERDDAP . De plus, j'essaie d'écrire du code très propre. J'écris des commentaires Java Doc. J'écris des commentaires dans le code. J'ai choisi les noms de variables avec soin. Je suis les directives de formatage Java . Tout cela est un effort pour rendre le code plus lisible, pour les autres programmeurs qui veulent le comprendre et/ou le modifier, et pour moi, car, dans un an ou deux, j'aurai oublié les détails du comment et du pourquoi du code. a été écrit tel quel. Un code propre avec de bons commentaires facilite mon travail en cours sur ERDDAP, je suis donc fortement incité à écrire du code propre avec de bons commentaires.

Mais toutes mes réponses jusqu’à présent ne sont pas très importantes. Une seule chose qui est vraiment importante. Une seule chose garantit la durabilité d' ERDDAP ou de tout projet logiciel : ERDDAP soit un logiciel libre et open source (FOSS).  (external link) . Plus précisément, ERDDAP utilise des licences logicielles compatibles Apache  (external link), afin que chacun puisse faire ce qu'il veut avec le code.

Pourquoi est-ce important ? On pourrait penser que les logiciels seront disponibles de manière fiable à l’avenir parce qu’ils sont soutenus par une grande entreprise. Mais Google, par exemple, a abandonné de nombreux projets (voici une liste  (external link)). Je ne veux pas m'en prendre à Google parce que j'aime vraiment Google et qu'il finance un grand nombre de grands projets open source. Microsoft a arrêté des projets. Apple a abandonné ses projets. … Le fait est que le simple soutien d'une grande entreprise ne garantit pas la poursuite du projet. Les utilisateurs de ce logiciel n’ont pas de chance, à moins que le logiciel ne soit (et soit donc toujours) un logiciel libre et open source (FOSS). Ensuite, chaque fois qu’un seul développeur suscite l’intérêt, le projet peut et continuera d’évoluer. FOSS est une police d’assurance. En fait, le FOSS est la seule police d’assurance, la seule assurance qui compte. FOSS garantit qu'il y a toujours une voie à suivre pour le logiciel. C’est un droit que personne ne pourra jamais lui retirer.

On pourrait également penser que les logiciels dotés d’une grande équipe de développeurs seront plus durables que les logiciels dotés d’un seul développeur principal. Mais de nombreux développeurs ont généralement besoin de beaucoup de financement. Je connais un projet célèbre et assez important avec 10 développeurs (je ne les embarrasserai pas en les nommant) qui court constamment un grave danger d'arrêter le projet parce qu'ils n'ont pas suffisamment de financement. Ils comptent sur des subventions. Ils sont toujours en déficit. Leur patron les a toujours renfloués à la dernière minute, mais il en a vraiment marre de les renflouer. Donc s’ils ne parviennent pas à récolter un million de dollars par an en subventions (ou si le mécène est trop fatigué de les renflouer), ils arrêteront. Et le groupe ne conçoit pas moins de 10 développeurs. Chaque développeur a un rôle à jouer dans son groupe. À la lumière de cela, il me semble que c'est un bon signe ERDDAP puisse être, et est, activement développé par un seul développeur principal (qui est entièrement financé) avec l'aide non officielle de quelques autres. En fait, ce serait un mauvais signe si ERDDAP nécessitait plusieurs développeurs. Le fait que ERDDAP n'ait qu'un seul développeur principal signifie qu'il ne s'agit pas d'une tâche énorme qui nécessite un financement massif et continu ; il s'agit d'une tâche relativement modeste qui nécessite un minimum d'efforts et de financement. C'est plus durable, pas moins.

On pourrait penser que faire appel à une entreprise sous-traitante pour écrire des logiciels est une bonne idée. Moyennant des frais, ils fourniront des développeurs et promettront une continuité (ce qui est une bonne chose à moins/jusqu'à ce qu'ils fassent faillite). Mais ils vous ont aussi un baril : vous devez leur payer ce qu'ils demandent sinon il n'y a plus de développement, à moins que le logiciel soit un FOSS et que vous les payiez simplement pour travailler sur le code. Avec FOSS, vous avez toujours le choix quant à la manière d’avancer. Parce ERDDAP est un FOSS, les entrepreneurs sont toujours une bonne option pour vous ou pour n'importe qui en ce qui concerne ERDDAP : si quelque chose m'arrive (le seul développeur principal), ou si je n'ai pas le temps d'apporter les modifications que vous souhaitez, ou si je prenez votre retraite et vous n'aimez pas le travail de mon remplaçant, vous pouvez toujours faire appel à une entreprise contractante pour apporter les modifications que vous souhaitez (ou les effectuer vous-même).

En résumé, ERDDAP présente les deux caractéristiques de durabilité qui comptent le plus :

  1. ERDDAP est un petit projet (suffisamment petit pour être géré par un développeur principal avec l'aide non officielle de quelques autres), il ne nécessite donc pas de ressources massives.
  2. ERDDAP est un logiciel libre et open source, donc personne ne pourra jamais vous empêcher, vous ou quiconque, de travailler sur ERDDAP .
Je ne peux pas penser à une meilleure situation. J'espère que cela dissipe toutes vos craintes (ou n'importe qui d'autre) concernant la durabilité de ERDDAP . Si vous entendez des gens remettre en question ou décourager l'utilisation d' ERDDAP parce qu'il n'y a qu'un seul développeur principal, veuillez les mettre au clair en les dirigeant vers la discussion ci-dessus à cette URL : https://coastwatch.pfeg.noaa.gov/erddap/information. html#durable .
 

Comment citer un ensemble de données dans un article
Il est important de faire savoir aux lecteurs comment vous avez obtenu les données que vous avez utilisées dans votre article. Pour chaque ensemble de données que vous avez utilisé, veuillez consulter les métadonnées de l'ensemble de données dans la section Structure des attributs de l'ensemble de données au bas de la page .html de l'ensemble de données, par exemple :
https://coastwatch.pfeg.noaa.gov/erddap/griddap/jplMU RSS T41.html . Les métadonnées incluent parfois un format de citation requis ou suggéré pour l'ensemble de données. Les métadonnées « licence » répertorient parfois des restrictions sur l'utilisation des données.

Pour générer une citation pour un ensemble de données :
Si vous considérez l'ensemble de données comme un article scientifique, vous pouvez générer une citation basée sur l'auteur (voir les métadonnées « nom_créateur » ou "institution" ), la date à laquelle vous avez téléchargé les données, le titre (voir les métadonnées "title" ), et l'éditeur (voir les métadonnées "publisher_name"). Si possible, veuillez inclure la ou les URL spécifiques utilisées pour télécharger les données. Si les métadonnées de l'ensemble de données incluent un identifiant d'objet numérique (DOI )  (external link), veuillez l'inclure dans la citation que vous créez.
 

Comment citer ERDDAP dans un article
Si vous souhaitez citer ERDDAP lui-même dans un article scientifique, veuillez utiliser quelque chose comme
Simons, RA et Chris John. 2022. ERDDAP . https://coastwatch.pfeg.noaa.gov/erddap . Monterey, Californie : NOAA / NMFS / SWFSC / ERD .

Que signifie l'acronyme « ERDDAP » ?
« ERDDAP » était autrefois un acronyme, mais il a dépassé la description originale. Maintenant, s'il vous plaît, considérez-le simplement comme un nom, pas comme un acronyme.
 

Lignes directrices pour les systèmes de distribution de données
Les opinions de Bob sur la conception et l'évaluation des systèmes de distribution de données peuvent être trouvées ici .
 

Vous pouvez configurer votre propre serveur ERDDAP et servir vos propres données.

Contactez-nous

Si vous avez des questions, des suggestions ou des commentaires sur ERDDAP en général (pas sur cette installation ERDDAP spécifique), veuillez envoyer un e-mail à erd dot data at noaa dot gov et inclure l'URL ERDDAP directement liée à votre question ou commentaire.
Vous pouvez également rejoindre le groupe Google/liste de diffusion ERDDAP en visitant https://groups.google.com/forum/#!forum/erddap  (external link) et en cliquant sur "Demander l'adhésion". Une fois que vous êtes membre, vous pouvez y poster votre question ou effectuer une recherche pour voir si la question a déjà été posée et répondue.

AVIS DE NON-RESPONSABILITÉ : Les opinions exprimées sur cette page Web sont celles de Bob Simons et ne reflètent pas nécessairement la position du gouvernement ou de la National Oceanic and Atmospheric Administration .


 
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